Um ein gewisse Basissicherheit nach der Installation zu erhalten, kann das mitgelieferte Programm:
# mysql_secure_installation
verwendet werden. Dieses setzt ein root Passwort, fragt nach der Verwendung von Fernzugriffen und ermöglicht die Löschung der Beispieldatenbanken.
Mehr oder weniger bekannte Tools für den angenehmen Umgang mit MySql sind